光绪是清朝所有皇帝中最让人值得同情的皇帝，他的一生太过曲折，在慈禧的魔掌之下没有过上几天好日子，这个悲苦皇帝，傀儡皇帝，囚徒皇帝，最后究竟是怎么死的呢？
光绪三十四年十月二十一日日（1908年11月14日），38岁的光绪皇帝在中南海瀛台涵元殿离开了人世。第二天下午，他的母后及政敌、操纵晚晴政权半个世纪之久的慈禧太后，也死在中南海仪鸾殿内，终年74岁。
光绪帝死了，而且死在了慈禧去世的前一天，有人认为光绪帝之死很蹊跷。曾经是清宫御医的屈贵庭说，在光绪临死的前三天，他最后一次进宫为皇上看病，发现光绪本已好转的病情突然恶化，在床上乱滚，大叫肚子疼。没过几天，光绪便死了。于是，关于光绪之死有多种说法。
一，被慈禧害死
这种说法最为广泛，因为慈禧扼杀了戊戌变法，杀害了光绪帝的宠妃珍妃，两个人之间的仇恨很深，慈禧惧怕自己死后，光绪帝翻旧案，所以，眼看自己不行了，赶紧杀害光绪帝。这在很多史籍中都有类似的记载。
二，被袁世凯害死
溥仪在《我的前半生》一书中谈到，袁世凯在戊戌变法时辜负了光绪的信任，在关键时刻出卖了皇上，他担心一旦慈禧死去，光绪绝不会轻饶了他，所以就借进药的机会，暗中下毒，将光绪毒死。
三，被李莲英害死
毫无疑问，李莲英是奉了太后之命，因为慈禧要害死光绪帝，李莲英平时和光绪积怨已深，万一太后去世，光绪帝定会加罪于李莲英。所以，李莲英和慈禧密谋，赶紧除掉光绪帝。李莲英便借助进药之机，毒死了光绪帝。
四，自然死亡
《德宗实录》《光绪朝东华录》《清史稿》等史籍内，均记载光绪系自然死亡。从光绪帝的脉案中也确实觉得他已经病入膏肓，光绪帝曾在无奈中屡次责怪御医。
光绪三十四年（1908）五月二十六日，他说："屡易方药，任属加重。"七月十七日，他在责备御医无能："服药非但无功，而且转增，实系药与病不相合，所以误事。"八月初七日，他更申斥御医："每次看脉，忽忽顷刻之间，岂能将病详细推敲？不过敷衍而已。素号名医，何能如此草率！"等等。
这样，到十月十一日子刻，光绪帝开始进入弥留之际，脉案记载："皇上脉息如丝欲绝，肢冷气焰，二目上翻，神识已迷，牙关紧闭。午刻，目直视，唇反鼻扇，阳散阴涸，酉刻，龙驭上宾。"
进入21世纪，光绪帝之死再次引起人们的关注。北京市公安局刑事侦查总队、法医检验鉴定中心、中国原子能科学院、清西陵文管处的同志们运用中子活化实验方法，对采集来的光绪头发、衣物等，放在原子荧光之下进行"中子活化""X射线荧光分析""原子荧光光度""液相色谱"等一系列现代技术检测。
结果出来后发现，光绪帝头发上的高含量砷并非为慢性中毒自然代谢产生，而是来自于外部沾染。通过对其殡葬衣物被侵蚀的规律以及衣物上砷元素含量的分布情况分析，进一步证实了光绪帝的腐败尸体是砷元素污染的唯一来源。由砷种态分析得知，光绪帝遗骨、头发、衣物中高含量的砷化合物为剧毒的三氧化二砷，即砒霜；经过科学测算，光绪帝摄入体内的砒霜总量明显大于致死量。
经过反复的检验和缜密的分析研究，得出"光绪帝系砒霜中毒死亡"的最终检验结论。