海迷失虽然和乃马真皇后有着一样的野心，但是却不具备乃马真那样的心计和谋略，与托雷妃唆鲁禾帖尼相比就差得更远了。因此，在贵由汗过世后，海迷失在较短的时间内曾听政监国，但终因她不具备管理国家的能力，不仅儿子们背叛她，最终还落得一个被沉河溺死的下场。1248年，43岁的元定宗贵由死在征途中。当时随驾西征的斡兀立·海迷失皇后秘不发丧，只是派人将此事告之拖雷妃唆鲁禾帖尼和拔都，自己则怀抱窝阔台的幼孙失烈门匆忙赶回和林，自行称制。海迷失称制两年多的时间，忽里台大会迟迟没有召开。在此期间，她曾在窝阔台家族统治的地区接见了来自法兰西路易九世的使者、天主教多米尼克修会的三位教士：安德烈·德·朗朱米和他的兄弟盖依，以及让·德·卡尔卡松。

海迷失后称制二年（1250年）七月，她还对蒙古国的税费制度进行了改革。《大元马政记》中记载，当时的蒙古政府会对游牧民的牧群征税，这种税构成了游牧民对中央政府的主要财政义务。最初在元太宗六年（1234年）的时候，蒙古政府规定每户人家每百头牲畜须纳一头。根据这种制度，拥有牲畜数目少于百头的牧人就不在纳税人之列。但是到了海迷失后称制二年七月，海迷失还是想将汗位传给窝阔台系的王子，或者是窝阔台死之前钦定的失烈门，再或者就是她与贵由所生的忽察（此时还很年幼）。然而，由于海迷失之前的所作所为，窝阔台系的威信彻底破产。蒙古帝国中身份兵力都首屈一指的，非术赤家族的拔都莫属，拔都又向来与窝阔台家族的人不和，借这次选择新汗的机会，他决定排除窝阔台系。更准确地说，他与拖雷的遗孀唆鲁禾帖尼联合起来，想借此机会将窝阔台家族的人赶下汗位，由于之前唆鲁禾帖尼曾在贵由欲讨伐拔都时及时给他报信，有恩于他，再加上拔都深知自己不可能夺得汗位，于是便卖了个顺水人情，提名唆鲁禾帖尼与拖雷所生的长子蒙哥为大汗。

大约于1250年在伊塞克湖以北、拔都的阿拉喀马克营地，拔都召集诸王在此召开了忽里台大会，会上在召开此次忽里台大会之前，拔都曾广发"英雄帖"，召集众宗王前去他的封地召开会议。除了蒙哥在唆鲁禾帖尼的授意下亲自到场外，包括海迷失在内的很多窝阔台系和察合台系的亲王们并没有前往，不过慑于拔都的实力，他们还是纷纷派了代表前去。因此这次的选举结果一出，海迷失第一个就表示不同意，并提出在和林再召开一次忽里台大会。拔都也不计较，就派人护送蒙哥东去和林参加选举，而自己则驻在西方做后援。召开大会之时，窝阔台与察合台系的宗王都知道争不过拔都和蒙哥，都不到会，结果依然是蒙哥当选。

蒙哥即位之后，察合台系与窝阔台系中那些宗王们见大势已定，这才纷纷前去道贺。然而，在道贺的背后，心有不甘的海迷失还有另一重打算。正当蒙哥和诸位亲王庆祝宴饮之时，蒙哥的一个养鹰人克薛杰到草原的另一边去寻找自己丢失的骆驼，无意中遇到了一支带着许多大车的军队。起初，克薛杰以为这是一支军需车队，专门给宴会供应食物的，因此并没有在意。就在他打算走开的时候，车队中的一个孩子叫住了他，请求他帮忙修理一辆坏了的大车。克薛杰一将车盖打开，顿时大吃一惊：车里竟然全是精良的兵器！修好车后，克薛杰又和周围的人拉家常，这才得知所有的大车里都装着同样的东西。原来，海迷失的儿子脑忽、窝阔台的孙子失烈门和另外一位窝阔台系的王爷忽突黑运了大批兵器到此地，打算趁着蒙哥及诸王欢歌狂醉之机将他们一网打尽，然后夺走汗位。克薛杰一听到这个消息，立即纵马狂奔回营地。原本三天的路程，他一天就赶到了，并当面向蒙哥禀报此事。蒙哥立即派大将忙哥撒儿率三千骑去"迎接"脑忽等三人和他们的军队。天助蒙哥，这三人只带了几百随从，却走在离自己的军队辎重很远的地方，结果可想而知，被活捉了去见蒙哥。

脑忽、失烈门、忽突黑被蒙哥抓住了把柄，好汉不吃眼前亏，只好承认蒙哥的大汗身份。毫无反抗之力的三人被蒙哥给扣押了起来，见此，其他没有来参加称汗大会的察合台及窝阔台系的诸王纷纷前往和林澄清自己。借着这个机会，蒙哥和拔都大举清除异己分子。如察台台的孙子布里，虽然他对蒙哥继位毫无意见，却因酒醉辱骂拔都而被杀。之后，蒙哥又派出使者传召海迷失和贵由长子忽察，忽察在一个妃子的劝说下承认了蒙哥的大汗地位，保住了身家性命，从此被软禁。但是海迷失皇后态度却很强硬，她以摄政者的身份质问蒙哥："各系宗王们都曾经发过重誓，大汗之位只能由窝阔台家族的子孙来传承。

如今你们自食其言，不守信用！"面对海迷失皇后的责问，蒙哥终究还是有些心虚，只能避重就轻地指责海迷失皇后想当女王，并派人强行用生牛皮绑住她的手把她抓到和林去。就在和林，曾经做过近三年摄政女王的海迷失遭到了非人的折磨。负责审问的忙哥撒儿下令对她裸身处刑，海迷失极力驳斥，但没有任何用处，最终在对方的严刑逼供下被迫认"罪"。随后，海迷失便被判处死刑，与失烈门的母亲合答合赤哈敦一起，被裹入大毡抛入河中溺死。蒙哥的弟弟忽必烈把失烈门带往驻扎在中国的蒙军中，暂时救了他，但后来蒙哥还是把这个可怜的年轻人投入水中淹死，而忽察则被放逐到哈拉和林以西的地区。蒙哥消灭了海迷失皇后这个最重要的对手之后，继续削弱窝阔台家族的势力，仅是诸将大臣就杀了77个，这才坐稳了汗位。