爵位和职务从来就不是一个绝对成比例的东西，许多位极人臣的人、尤其是文臣，一辈子也没有获得过任何爵位。最典型的例子莫过于明朝的张居正了，在万历朝的前十年里，张居正权势熏天，说他是"站皇帝"恐怕也并不为过。可张居正一辈子什么爵位也没获得过，哪怕是明朝最低等级的伯爵……反之，明王朝明确规定，皇后、皇太后的亲爹皆授予伯爵爵位，但不允许出任任何官职。换言之，这些伯爵虽然有品级、有俸禄，却没有任何职务在身。
秦琼的翼国公、包括后来的胡国公是爵位，左武卫大将军是职务，二者并不矛盾。别说是国公出任左武卫大将军了，一些袭爵的公爵、侯爵二代、三代等等担任中层官职的也得大有人在！按照唐制，国公为从一品，但这只是一个品级、对应着相应的待遇，但与职务、权力无关。简单说就是，享受相关待遇、但没有实际权力，如果国公不出任具体官职，那他就是个拥有崇高地位的"土财主"而已。
左武卫大将军就不同了，这虽然只是一个正三品的职务，但确实实打实手握重兵、重权的军职。据相关史料记载，唐朝的左武卫大将军"掌宫禁宿卫，凡翊府之翊卫、外府熊渠番上者，分配之"。再说简单一些，唐朝的左武卫大将军与后世清朝的领侍卫内大臣、步军统领（九门提督）有不少相似之处。皇帝连自家的身家性命都交给他了，谁敢说他的权力不大？
再者，唐朝的正三品和清朝按察使、参将的正三品根本不是一回事。唐朝的正牌宰相--中书省中书令、门下省侍中也不过正三品而已，即便是尚书省的实际长官--尚书左右仆射，也不过从二品，正三品在唐朝已经近乎是实职中的最高品级了。正三品往上，除了尚书左右仆射和唐太宗李世民曾经担任过的天策上将、尚书令（贞观后长期空置）之外，都是虚职。说白了就是给大臣提高待遇用的，没有任何实权可言。比如三公、三师和"开府仪同三司"，看似位高权重，实际上就是个虚名而已，如果皇帝只给了你这些、却没有实际职务给你，其实就是让你回家养老了……
那么，秦琼到底算几品官呢？当然是按高的算，从一品。政治待遇、经济待遇从来都不是皇帝看中的东西，不就是多给点面子、房子、银子、女子嘛，皇帝最不缺的就是这些。但权力是不会多给的，一丝一毫也不行！秦琼的政治、经济待遇虽然是从一品等级，但实际权力却只能按照左武卫大将军给。真要是出去打仗了，再临时给个什么行军大总管之类的职务，打完仗收回、您该干嘛还干嘛去……
所以说，秦琼的翼国公和左武卫大将军并不矛盾，并不是由从一品降为了正三品，而是正一品的国公担任了正三品的实际职务。提问者之所以提出这个问题，要么是无知，要么就是在误导众人，无外乎是暗示秦琼没有参加"玄武门之变"，后来让唐太宗李世民"降级"了，不是吗？根本没有这么一回事！贞观年间，秦琼的爵位依然是国公，只不过由翼国公改为了胡国公而已，还是从一品！
秦琼虽然本身没有参与"玄武门之变"，但作为唐高祖李渊系的"军中大佬"，他能够"保持中立"，其实就已经表明自己的态度了，李世民又为什么要跟他过不去？与秦琼情况类似的还有李靖，李靖同样是李渊系的"军中大佬"，他在"宣武门之变"前后同样选择了"保持中立"。"保持中立"不代表暧昧、不是待价而沽，它本身其实就是一种态度！连一直紧跟李渊的陈叔达等人李世民都能容得下，更何况是秦琼？